בפעם הראשונה בעולם מתמודדים ומתמודדות בני 12 עד 15 עולים על המסלול של הגדולים! קבלו גרסת הנוער של התוכנית שהתחילה ביפן, סחפה את העולם והגיע גם לישראל: "נינג'ה ישראל ילדים". את התוכנית מנחים אליאנה תדהר ועודד פז יחד עם כוכב הרשת קווין רובין בתפקיד מנחה הקווים.
ישראל היא המדינה השניה בעולם להשיק גרסאת ילדים לנינג'ה (אחרי ארצות הברית). לעומת הגרסה האמריקאית בשם נינג'ה ג'וניור ארה"ב, ב"נינג'ה ישראל ילדים" התוכנית מצולמת על המסלול של הגדולים עם שינויים קלים (הוספת מאחזי טיפוס לקיר ופישוט המכשולים).
"נינג'ה ישראל ילדים" כוללת שלושה שלבים: מוקדמות, חצי גמר וגמר. שלב המוקדמות בנוי שלושה מקצים: "מקצה הסחרחורת", "מקצה התעתועים" ו"מקצה האטרף". סה"כ יש 10 מכשולים משתנים וכמה מכשולים קבועים: הסטפר, גשר הלהב השבור והקיר.
בשלב חצי הגמר מתווספים חמישה מכשולים קשים יותר ובשלב הגמר מופיעים כל חמשת המכשולים משלב חצי הגמר יחד עם שדרוג שמעלה את דרגת השוקי. לאחריהם יצטרכו לעבור המתמודדים שני מכשולים נוספים בתקווה להעלות לבאזר וללחוץ עליו.